MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Sat464 plasmid pHPSAT464

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017356	AAGGA	2	10	1600	1609	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017356	TCAA	2	8	2380	2387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017356	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017356	ATGAA	2	10	2472	2481	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017356	GGT	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017356	ATCT	2	8	2608	2615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017356	T	6	6	2740	2745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017356	AAGT	2	8	2875	2882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017356	TGAA	2	8	2886	2893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017356	A	7	7	2916	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017356	CTTT	2	8	2942	2949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017356	A	6	6	2961	2966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017356	T	6	6	2984	2989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017356	TGCTA	2	10	3096	3105	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017356	CTT	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017356	GAAGT	2	10	3166	3175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017356	TGT	2	6	3214	3219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017356	AACA	2	8	5377	5384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017356	ACAAA	2	10	5434	5443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017356	T	6	6	5449	5454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017356	GCG	2	6	5460	5465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017356	TTA	2	6	5491	5496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017356	ACTCAA	2	12	5546	5557	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017356	AAAC	2	8	5580	5587	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017356	CCTAAT	2	12	5668	5679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017356	C	6	6	5684	5689	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_017356	ACA	2	6	5690	5695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017356	TTTTC	2	10	5723	5732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017356	ACCCT	2	10	5773	5782	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017356	T	6	6	5845	5850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017356	T	6	6	5852	5857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017356	CTTTTT	2	12	5860	5871	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017356	T	8	8	5867	5874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017356	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017356	A	8	8	5909	5916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017356	CATGA	2	10	5927	5936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017356	GAAA	2	8	5970	5977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017356	CTTT	2	8	5985	5992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017356	AATTT	2	10	6119	6128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017356	ATT	2	6	6166	6171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017356	G	6	6	6181	6186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017356	T	6	6	6224	6229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017356	TAG	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017356	TAG	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017356	TAG	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017356	CAT	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017356	GTT	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017356	T	6	6	6990	6995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017356	ACC	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017356	CTT	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017356	CTT	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017356	CTT	2	6	7146	7151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017356	CTT	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017356	A	7	7	7195	7201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.